La surveillance des récifs coralliens a été réalisée pour la couverture benthique, la biomasse des poissons de récif et les macro-invertébrés sur neuf sites permanents répartis sur trois principaux types de récifs, avec des informations préliminaires collectées sur un dixième site (un récif en patch au large des profondeurs). Les données de suivi ont fourni plus de détails sur l'état des récifs coralliens, complétant et améliorant le suivi existant réalisé dans la région d'Andavadoaka.
Une évaluation de la biodiversité marine dans la région d'Andavadoaka a été réalisée par des experts taxonomiques internationaux pour les coraux durs, les poissons de récif et les mollusques marins dans une gamme d'habitats et de types de récifs.
L'état des récifs coralliens de la région variait entre les principaux types de récifs. Les récifs frangeants côtiers étaient généralement en mauvais état avec une faible couverture de coraux durs, une forte couverture algale non calcifiée et une faible biomasse de poissons de récif. Les récifs-barrières faisant face à la mer sont en meilleur état avec une couverture corallienne et une biomasse de poissons de récif légèrement plus élevées. Les récifs en plaques de moins de 10 mètres de profondeur étaient dans les meilleures conditions avec une couverture corallienne élevée, une complexité structurelle élevée et la plus grande biomasse de poissons de récif. On pense que de vastes événements de blanchissement des coraux sont responsables de la faible couverture de coraux durs sur les récifs peu profonds (<10 m de profondeur).
La biomasse totale des poissons de récif (14 familles principales) était similaire aux niveaux trouvés pour les récifs modérément exploités en Afrique de l'Est et à Beheloka, au sud-ouest de Madagascar. La biomasse de certaines familles de poissons herbivores était faible sur les récifs frangeants (Acanthuridés) tandis que la biomasse des Scaridés était réduite sur tous les sites étudiés.
La densité des macro-invertébrés variait entre les principaux types de récifs avec des densités plus élevées d'oursins herbivores et d'étoiles de mer (Linckia spp.) sur les récifs frangeants et des densités plus élevées de bénitiers géants, d'holothuries et de grands Cypraeads sur les récifs au large.
Les évaluations de la biodiversité ont révélé des niveaux de biodiversité moyens pour les coraux durs et les poissons de récif et une biodiversité élevée pour les mollusques marins. Certains genres de coraux durs ont été enregistrés moins souvent que prévu, ce qui est probablement lié à la mortalité due au blanchissement. Les poissons de récif spécialisés associés aux zones coralliennes riches étaient également absents.
Les évaluations de la biodiversité ont également montré que pour conserver de manière adéquate le nombre maximum d'espèces, il est nécessaire de protéger la gamme complète des habitats des récifs coralliens à travers les différents types de récifs présents dans la région. En particulier, le complexe récifal de patch et l'extrémité sud du récif de Nosy Hao sont recommandés pour une protection complète.
Un certain nombre de recommandations pour la gestion sont proposées, y compris l'utilisation de plusieurs zones pour les zones marines protégées et d'utilisation des ressources, des restrictions sur les pratiques de pêche destructrices, une enquête complète sur une gamme de moyens de subsistance alternatifs pour les pêcheurs et le renforcement des capacités de gestion communautaire au sein des villages locaux.
Il est crucial que la gestion de toute aire marine protégée désignée dans la région se fasse avec la pleine coopération et le soutien continu des communautés locales.