Pemantauan terumbu karang diselesaikan untuk tutupan bentik, biomassa ikan karang, dan invertebrata makro di sembilan lokasi permanen di tiga tipe terumbu utama dengan informasi awal dikumpulkan di lokasi kesepuluh (tambalan terumbu lepas pantai dalam). Data pemantauan memberikan perincian lebih lanjut tentang status terumbu karang, melengkapi dan meningkatkan pemantauan yang ada yang diselesaikan di wilayah Andavadoaka.
Penilaian keanekaragaman hayati laut di wilayah Andavadoaka dilakukan oleh para ahli taksonomi internasional untuk karang keras, ikan karang, dan moluska laut di berbagai habitat dan tipe karang.
Kondisi terumbu karang di wilayah tersebut bervariasi antar tipe terumbu utama. Terumbu tepi pantai umumnya dalam kondisi buruk dengan tutupan karang keras yang rendah, tutupan alga yang tidak terkalsifikasi tinggi dan biomassa ikan karang yang rendah. Terumbu penghalang yang menghadap ke laut berada dalam kondisi yang lebih baik dengan tutupan karang dan biomassa ikan karang yang sedikit lebih tinggi. Patch terumbu di bawah kedalaman 10 meter berada dalam kondisi terbaik dengan tutupan karang yang tinggi, kompleksitas struktural yang tinggi dan biomassa ikan karang terbesar. Peristiwa pemutihan karang yang ekstensif dianggap bertanggung jawab atas rendahnya tutupan karang keras di terumbu dangkal (kedalaman <10 m).
Biomassa total ikan karang (14 famili utama) serupa dengan tingkat yang ditemukan pada terumbu karang dengan penangkapan sedang di Afrika Timur dan Beheloka, barat daya Madagaskar. Biomassa untuk beberapa keluarga ikan herbivora rendah di terumbu tepi (Acanthurids) sementara biomassa Scarid berkurang di semua lokasi yang disurvei.
Kerapatan makro-invertebrata bervariasi antara jenis terumbu utama dengan kepadatan lebih tinggi dari bulu babi herbivora dan bintang laut (Linckia spp.) di terumbu tepi dan kerang raksasa, holothurian, dan Cypraead besar dengan kepadatan lebih tinggi di terumbu lepas pantai.
Penilaian keanekaragaman hayati mengungkapkan tingkat keanekaragaman hayati sedang untuk karang keras dan ikan karang dan keanekaragaman hayati yang tinggi untuk moluska laut. Beberapa genera karang keras tercatat lebih jarang dari yang diperkirakan yang kemungkinan besar terkait dengan kematian akibat pemutihan. Ikan karang spesialis yang diasosiasikan dengan kawasan karang yang kaya juga tidak ada.
Penilaian keanekaragaman hayati juga menunjukkan bahwa untuk melestarikan jumlah maksimum spesies secara memadai, perlu untuk melindungi seluruh habitat terumbu karang di berbagai jenis terumbu yang ada di wilayah tersebut. Khususnya kompleks patch reef dan ujung selatan terumbu Nosy Hao direkomendasikan untuk perlindungan penuh.
Sejumlah rekomendasi untuk pengelolaan diusulkan termasuk penggunaan beberapa zona untuk kawasan perlindungan dan pemanfaatan sumber daya laut, pembatasan praktik penangkapan ikan yang merusak, penyelidikan penuh terhadap berbagai mata pencaharian alternatif bagi nelayan dan pembangunan kapasitas untuk pengelolaan berbasis masyarakat di desa-desa setempat.
Sangat penting bahwa pengelolaan setiap kawasan lindung laut yang ditunjuk di wilayah tersebut dibuat dengan kerjasama penuh dan dukungan berkelanjutan dari masyarakat setempat.